L’Intransigeant fut fondé par Eugène Mayer, directeur de La Lanterne, pour le polémiste Henri Rochefort, opposant historique au Second Empire. Il comporte quatre pages et est vendu 5 centimes. À sa création, il est tiré à 70 000 exemplaires. Ses locaux sont situés rue Réaumur, dans le 2^e arrondissement de Paris.

Le journal suit les revirements politiques de Rochefort qui en est le rédacteur en chef : d'abord socialiste, L'Intransigeant critique dans un premier temps la politique des républicains opportunistes, en particulier Jules Ferry. Le quotidien se rallie ensuite au boulangisme, puis au nationalisme, participant en 1898 au déchaînement antisémite contre Dreyfus.

En octobre 1905, Léon Bailby est nommé rédacteur en chef par Rochefort. Il prend la direction du journal en novembre 1907. Dans les années 20, le quotidien devient un des principaux journaux du soir, avec un tirage de 400 000 exemplaires.

En décembre 1932, après la démission de Léon Bailby, le journal est acheté par le groupe Louis-Dreyfus. Son orientation politique se déplace vers le centre. À la même époque, sa situation financière ne cesse de se détériorer : confronté à la concurrence de Paris-soir, il ne tire plus à la fin des années 30 qu'à 130 000 exemplaires. En décembre 1936, Jean Fabry en reprend la direction.

Le 11 juin 1940, après la débâcle, le journal est l'un des rares à se saborder. Il fera une courte réapparition à partir du 13 mai 1947 avec Paul Gordeaux en rédacteur en chef, avant d'être absorbé, le 30 septembre 1948, par Paris-Presse.